Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ulk4Q3V129 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ulk4Q3V129 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms