Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrfip1Q3UZ39 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms