Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnpc3Q3UZ01 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnpc3Q3UZ01 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms