Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
B230104I21RikQ3USW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms