Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms