Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms