Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BtrcQ3ULA2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BtrcQ3ULA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BtrcQ3ULA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms