Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ell2Q3UKU1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ell2Q3UKU1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ell2Q3UKU1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ell2Q3UKU1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ell2Q3UKU1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms