Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ceacam12Q3UKP4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ceacam12Q3UKP4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ceacam12Q3UKP4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms