Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc61Q3UJV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc61Q3UJV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms