Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf224Q3UIW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf224Q3UIW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms