Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc177Q3UHB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms