Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil3Q3UFQ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil3Q3UFQ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Carmil3Q3UFQ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms