Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn7l3bQ3UD01 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms