Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pid1Q3UBG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pid1Q3UBG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms