Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hvcn1Q3U2S8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hvcn1Q3U2S8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms