Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc9Q3U0M1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms