Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd33bQ3U0L2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms