Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tbc1d2bQ3U0J8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d2bQ3U0J8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms