Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms