Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd1Q3TXS7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd1Q3TXS7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms