Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms