Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxw18Q3TSA9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxw18Q3TSA9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxw18Q3TSA9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms