Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calr4Q3TQS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Calr4Q3TQS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms