Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms