Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc102aQ3TMW1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms