Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Smarca4Q3TKT4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Smarca4Q3TKT4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Smarca4Q3TKT4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms