Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Eepd1Q3TGW2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eepd1Q3TGW2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eepd1Q3TGW2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eepd1Q3TGW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms