Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RubcnlQ3TD16 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnlQ3TD16 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnlQ3TD16 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms