Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms