Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP4

Gm17416, Beta-defensin (Fragment), mousemouse

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Length 66 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17416Q30KP4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17416Q30KP4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17416Q30KP4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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