Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm1Q2TV84 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm1Q2TV84 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms