Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lgQ1ERP8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms