Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cers3Q1A3B0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms