Protein–RNA interactions for Protein: Q14B98

Fam109b, Sesquipedalian-2, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam109bQ14B98 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam109bQ14B98 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam109bQ14B98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam109bQ14B98 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam109bQ14B98 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam109bQ14B98 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam109bQ14B98 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam109bQ14B98 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms