Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli2Q0VGT2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli2Q0VGT2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms