Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b3Q0VF55 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms