Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hif3aQ0VBL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms