Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnnm1Q0GA42 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnnm1Q0GA42 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms