Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn2Q08093 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms