Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdx4Q07424 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms