Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf3Q07104 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms