Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrx2Q06348 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms