Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspg2Q05793 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hspg2Q05793 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms