Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox13Q04891 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms