Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Emx2Q04744 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx2Q04744 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms