Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx1Q04742 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx1Q04742 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx1Q04742 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx1Q04742 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Emx1Q04742 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx1Q04742 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx1Q04742 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms