Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg2Q03517 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg2Q03517 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms