Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms