Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms